Résumé
En 2025, la République Démocratique du Congo (RDC) fait face à sa crise de choléra la plus sévère depuis deux décennies. Cependant, le diagnostic clinique et les tests rapides (TDR) se limitent souvent à l'identification d'un seul pathogène, ignorant la complexité des co-infections. Cette étude évalue la prévalence de la salmonellose, de la shigellose et des souches d’E. coli chez les patients atteints de diarrhée. Le but du présent travail était de mettre en évidence les cas de co-infections bactériennes entériques chez les patients diarrhéiques en contexte épidémique en RDC. Étude observationnelle transversale fondée sur 255 prélèvements de selles analysés entre décembre 2025 et février 2026 par le panel PCR multiplex RADIOne 5-Plex. Les prévalences sont présentées avec IC95 %. Les associations par paires ont été explorées par tableaux 2×2, rapports de prévalence (RP), odds ratios (OR), tests du χ² ou exact de Fisher selon les effectifs. Une matrice et un réseau de co-occurrence pondéré par le nombre de co-détections ont complété l'analyse. Le seuil de significativité était de 5 %. V. cholerae a été détecté chez 207/255 patients (81,2 %; IC95 % 75,9–85,8), Shigella chez 118/255 (46,3 %; IC95 % 40,0–52,6), ETEC chez 85/255 (33,3 %; IC95 % 27,6–39,5), Salmonella chez 13/255 (5,1 %; IC95 % 2,7–8,6) et STEC chez 4/255 (1,6 %; IC95 % 0,4–4,0). Au moins deux pathogènes ont été détectés chez 138/255 patients (54,1 %). L'association Shigella–ETEC était significative (OR 1,85; IC95 % 1,09–3,14; p=0,021). L'association Salmonella–STEC était également significative (OR 21,82; IC95 % 2,81–169,66; p=0,014), mais reposait sur seulement quatre cas de STEC et doit être considérée comme exploratoire. Aucune association statistiquement significative n'a été démontrée entre le choléra et chacun des quatre autres agents. Ces résultats démontrent que la diarrhée en contexte épidémique de choléra en RDC n'est pas mono-pathogène. La haute fréquence des co-infections suggère une contamination environnementale saturée;
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